Há diferenças entre o que pode ser feito com um equipamento móvel (smartphone ou tablet) ligado por Wi-Fi (sem fios) ou com uma ligação USB (com fios)?

Não, não há.

Com qualquer um dos métodos de ligação, a rekordbox (iOS/Android) instalada no equipamento móvel pode ser utilizada para atuações de DJ. A rekordbox utilizará as faixas armazenadas no equipamento móvel.