Serato DJ以外のDJソフトウェアの機能をDJM-S9のボタンやつまみにアサインして使いたいのですが、各ボタンやつまみから出力されるMIDIコードを知ることは出来ますか？

MIDIコード表をご覧ください。

MIDIコード表は下記のAlphaTheta サポートページから入手可能です。

DJM-S9 その他MIDI対応ソフトウェア (http://www.pioneerdj.com/ja-jp/support/software-information/djm-s9#midi-compatible-software)