Mac OS で作成したカスタマイズデータやX-PAD のサンプリング音源のデータはWindows でも使えますか？

使う事ができます。Mac OS 上のremixbox で作成したカスタマイズパラメーターデータやサンプリング音源をSD カードに保存し、Windows 上のremixbox で使う事も出来ますし、その逆も出来ます。