外部機器からのクロックに同期させたとき、テンポ表示が変動するのですが正常ですか？

正常です。本機は受信したクロックパルスを使用してテンポを計算していますが、そのクロックパルスは時間的に短い変動（揺らぎ）を常に持っています。この変動によってテンポ表示も変動しますが、デバイスが同期しなくなっているわけではなく、聴感上も分かりません。