付属のTARKTOR SCRATCH DUO 2ソフトウェアをTRAKTOR SCRATCH PRO 2にアップグレードすることはできますか？

可能です。

TRAKTOR SCRATCH DUO2は、バージョン2.1.3以降にアップデートすることにより、無償でTRAKTOR SCRATCH PRO2にアップグレードすることが出来ます。

TRAKTORをアクティベートした際に登録したアカウントを使用してサポートサイトにログイン後、TRAKTOR SCRATCH PRO2のアップデーター（バージョン2.1.3以降）を入手してください。

詳しくはNative Instruments社の下記WEBサイトをご確認ください。