MULTI I/Oセクションの1/4"Jackを使用中にDJM-RECで録音可能ですか？

可能です。MULTI I/OセクションのMODEに関わらずDJM-RECは使用できます。

MULTI I/Oセクションの1/4"Jackに接続された外部エフェクターを使用している時もDJM-RECで録音することができます。